Kirié a rejoint les autres membres de UQ Holder et toute l'équipe se plonge dans des recherches parmi toutes les notes laissées par Negi dans son atelier, afin de trouver une stratégie pour vaincre Yolda, le mage du commencement. Mais soudain, une alarme retentit : l'ennemie passe à l'action ! Tôta et ses amis se préparent à partir pour Pluton…